Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Caracterización proteómica basada en gel de fracciones de proteínas solubles e insolubles en la médula espinal de rata

Shuguang Yang, Qinxue Ding, Yaojun Guo, Congjian Zhao, Yufeng Jia, Haiping Que, Hongxia Wang, Kaihua Wei, Dacheng He, Shuqian Jing y Shaojun Liu

La eficiencia del fraccionamiento y la caracterización de proteínas neurales solubles e insolubles mediante extracción secuencial se examinaron mediante análisis proteómico basado en gel . Las proteínas de la médula espinal de ratas adultas se extrajeron primero con tampón acuoso (fracción A), seguido de soluciones mejoradas estándar (fracción B) o modificadas (fracción C). De las 30 proteínas más abundantes en las fracciones A, B y C, el porcentaje de proteínas citoplasmáticas fue del 74 % (28/38), 37 % (14/38) y 42 % (15/36), respectivamente; las proteínas de organelos de membrana representaron el 8 % (3/38), el 45 % (17/38) y el 44 % (16/36); las proteínas de membrana representaron el 13% (5/38), el 18% (7/38) y el 14% (5/36). El número de dominios hidrofóbicos fue 5, 15 y 9. Las proteínas compartidas en tres fracciones fueron solo el 13%. Cuando se caracterizaron 30 puntos menos abundantes adicionales enriquecidos con la fracción insoluble C, las proteínas de membrana representaron el 31 %, de las cuales el 83 % eran proteínas de membrana periférica y el 17 % eran proteínas de membrana integral. El análisis funcional también reveló algunas diferencias entre las diferentes fracciones, aunque todas las proteínas fraccionadas están involucradas en el metabolismo energético, la regulación redox, la transducción de señales y la arquitectura celular.