Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

In Silico Predicción estructural, análisis y cálculo de energía de la proteína de unión al retinol 7 (RBP7) en Coturnix coturnix japonica (codorniz japonesa)

Aishwarya Tiwari, Vijay Laxmi Saxena y Mithun Kumar Patel

El retinoide natural biológicamente dinámico (retinol y sus metabolitos, vitamina A) es intermediado por proteínas extracelulares, intracelulares y nucleares en Coturnix japonica o codorniz japonesa. Los retinoides se transmiten principalmente por dos medios, como la proteína de unión a retinoides en plasma (RBP) y la proteína de unión al ácido retinoico epididimario (ERABP), que transporta el retinoide en el líquido corporal, mientras que las proteínas de unión al retinol celular (CRBP) y las proteínas de unión al ácido retinoico celular (CRABP) transportan los retinoides dentro de las células. . Es muy importante tener en cuenta la descripción precisa de los aminoácidos de RBP7 cuando se realiza la predicción de la estructura y el cálculo de la energía. El objetivo del estudio es predecir la estructura de RBP7 en Coturnix japonica utilizando herramientas bioinformáticas y un enfoque de software. Gráfico de Ramachandran del φ, ψ valores de los aminoácidos en una proteína RBP7. Usando este enfoque computacional, la energía total de RBP7 en Coturnix japonica es 1047.341 KJ/mol. Y la energía mínima total es 1026.898 KJ/mol en Cotunix japonica o codorniz japonesa. También se observa que se repiten las tendencias de energía en cada uno de los niveles moleculares, de grupos funcionales y atómicos. Los retinoles y el ácido retinoico desempeñan funciones esenciales en la variación de la expresión génica y el crecimiento general del embrión en Coturnix japonica. Esto hace que RBP7 sea más significativo en términos de expresión de tejidos adiposos en Coturnix japonica (codorniz japonesa) porque RBP7 funciona como un nuevo gen específico de tejido adiposo.