Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

GenoCMS: el sistema de administración de contenido para genes y proteínas

Ekaterina V Poverennaya, Nadezhda A Bogolubova, Elena A Ponomarenko, Andrey V Lisitsa y Alexander I Archakov

Los datos multifacéticos dispersos entre numerosos repositorios se convirtieron en el reverso de la medalla en la era posterior al genoma. A pesar de que las piezas de información se arrastran agresivamente, propusimos un sistema de administración de contenido web: genoCMS. El sistema diseñado para “domesticar” datos localmente mediante el muestreo de genes y volver a anotarlos de una manera definida por el usuario. El estilo de visualización de mapa de calor se implementó en genoCMS para facilitar al usuario la inspección de la cobertura de datos en una colección de genes. Usando genoCMS, hemos revisado los datos publicados recientemente sobre la extracción de transcriptomas y proteomas a gran escala. Se implementaron escenarios de demostración para ilustrar el flujo de trabajo de ordenar y seleccionar para destilar genes con perfiles deseables de las características.