Técnicas Avanzadas en Biología y Medicina
Acceso abierto

abstracto

¿Las técnicas de recuperación de antígenos mejoran el rendimiento de ADN a partir de tejido incluido en parafina fijado con formalina?

Subash Govender y Richard Naidoo

Este estudio investigó el uso de cocción a presión con diferentes soluciones de recuperación a pH variables para determinar el protocolo óptimo para la extracción de ADN de alta calidad de tejidos embebidos en parafina fijados en formalina (FFPE). Además, también se exploró el efecto de oxidación en los tejidos FFPE archivados en relación con la edad de los bloques de tejido. El objetivo principal del estudio fue investigar esta técnica en 11 cánceres gástricos. El diseño de nuestro estudio se basó en los principios de la técnica de recuperación de antígenos utilizando una olla a presión convencional para mejorar la calidad del ADN extraído de los tejidos FFPE. Además de los cánceres gástricos, se utilizaron linfoma, carcinoma de mama, próstata y colorrectal para eliminar el sesgo de tejido. La correlación estadística se realizó mediante la prueba t pareada y la prueba de Benjamini-Hochberg. Nuestros hallazgos muestran que se obtuvieron altas concentraciones de ADN utilizando las diferentes soluciones de recuperación con cocción a presión, en comparación con las muestras de control que no se sometieron a este procedimiento. La concentración media de ADN aumentó con todas las soluciones analizadas, pero el rendimiento de ADN fue significativamente mayor en 3 de las 4 soluciones de recuperación utilizadas. El uso de soluciones de recuperación de antígenos a alta presión y temperatura proporcionadas por la cocción a presión puede permitir revertir el efecto de entrecruzamiento de la formalina en los tejidos FFPE. Además, la observación de que el ADN extraído de bloques procesados recientemente tuvo un rendimiento superior en comparación con los bloques de tejido más antiguos, confirma que la oxidación tiene un efecto de deterioro en el ADN.