Investigación inmunológica
Acceso abierto

abstracto

Extracción de datos de ensayos de vacunas contra el cáncer: una vista panorámica

Karen B. Maloney y Vladimir Brusic

Antecedentes: Los registros en línea de acceso público han proporcionado una gran cantidad de información sobre ensayos clínicos. Los estándares de tecnología de la información e intercambio de datos permiten la extracción, el resumen y la visualización rápidos de la información y el conocimiento derivado de estos conjuntos de datos. Los datos de los ensayos clínicos se extrajeron en formato XML del sitio de la Biblioteca Nacional de Medicina ClinicalTrials.gov. Estos datos incluyen categorías como 'Resumen del propósito', 'Patrocinador del ensayo', 'Fase del ensayo', 'Estado de reclutamiento' y 'Ubicación'. Nos centramos en 645 ensayos clínicos relacionados con vacunas contra el cáncer. Se obtuvieron datos adicionales sobre los tipos de cáncer, incluidas las tasas de incidencia y supervivencia, de los datos de vigilancia del Instituto Nacional del Cáncer. Resultados: esta aplicación permite la extracción rápida de información sobre instituciones, enfermedades, enfoques clínicos, fechas de ensayos clínicos, tipos de cáncer predominantes en los ensayos, oportunidades clínicas y cobertura del mercado farmacéutico. La presentación de los resultados se ve facilitada por las herramientas de visualización que resumen el panorama de los ensayos de vacunas contra el cáncer en curso y finalizados. Nuestros resúmenes muestran la cantidad de ensayos clínicos de vacunas por tipo de cáncer, a lo largo del tiempo, por fase, por patrocinadores principales, así como la actividad de los ensayos en relación con el tipo de cáncer y los datos de supervivencia. También hemos identificado cánceres que se descuidan en el campo de las vacunas contra el cáncer: vejiga, hígado, páncreas, estómago, esófago y todos los cánceres de baja incidencia. Conclusión: Hemos desarrollado un enfoque de minería de datos que permite la extracción rápida de datos complejos del principal repositorio de ensayos clínicos. El resumen y la visualización de estos datos representan un medio rentable de tomar decisiones informadas sobre futuros ensayos clínicos de vacunas contra el cáncer.