Biología Sintética y de Sistemas Actual
Acceso abierto

abstracto

Caracterización del factor de transcripción sensible a la leucina de Vibrio cholerae patógeno mediante modelado molecular y análisis molecular Simulaciones dinámicas

Angshuman Bagchi

Vibrio cholarae es el agente causal del cólera. Es responsable de una variedad de enfermedades, específicamente las infecciones nosocomiales multirresistentes y las infecciones pulmonares crónicas en pacientes con fibrosis quística. Uno de los genes vitales del organismo responsable de su comportamiento resistente a múltiples fármacos es el gen PA3523 que codifica el transportador de salida de múltiples fármacos. La expresión de PA3523 está regulada por el factor de transcripción dimérico Lrp que tiene un motivo de unión al ADN Helix-Turn-Helix. Hasta el momento no ha habido informes previos que representen la caracterización de la proteína Lrp de Vibrio cholerae desde un punto de vista estructural. En el presente trabajo, se ha intentado caracterizar la proteína Lrp mediante un enfoque de bioinformática estructural. La estructura dimérica de Lrp se construyó mediante una técnica de modelado comparativo. A continuación, el modelo dimérico de Lrp se acopló a la región promotora correspondiente del gen PA3523 que codifica el transportador de salida de múltiples fármacos. El complejo acoplado de ADN promotor con proteína Lrp se sometió a simulaciones de dinámica molecular para identificar el modo de interacción de proteína de ADN. Hasta el momento, este es el primer informe que describe los detalles mecánicos de la regulación génica por la proteína Lrp. Por lo tanto, este trabajo puede ser útil para iluminar el mecanismo molecular aún oscuro detrás de la propagación de enfermedades por Vibrio cholerae