Revista de Proteómica y Bioinformática
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abstracto

Análisis del sesgo de uso de codones sinónimos en fagos de Pseudomonas Syringae: Implicación en la terapia con fagos para la enfermedad del tizón de Halo

Shashank Sharma, Ambrish Sharan Vidyarthi y Raju Poddar

La enfermedad del tizón de Halo causada por Pseudomonas syringae produce grandes pérdidas en frijoles secos. La terapia con fagos se puede probar como tratamiento alternativo. Para la evaluación del uso de codones sinónimos y la variación de codones, se tomaron 20 fagos de Pseudomonas para la prueba. El efecto de la concentración de GC en los fagos se puede considerar para analizar la virulencia en estos fagos. El sesgo mutacional y la selección traslacional también son factores importantes para predecir el sesgo apropiado, que se puede analizar a través del gráfico Nc y el análisis de correspondencia. Nuestro análisis indica que de 20 fagos, 3 fagos, a saber, el fago D3, D3112 y 119X, son extremadamente virulentos ya que tienen una alta eficiencia de traducción. Según nuestros datos, concluimos que el fago D3 será el más adecuado como terapia de fagos para el tratamiento contra la enfermedad del tizón de halo.